Sản lượng tôm nuôi ở nhiều nước trên thế giới chịu ảnh hưởng nặng nề bởi dịch bệnh EMS/AHPND.
Nguyên nhân gây bệnh được xác định là do vi khuẩn Vibrio parahaemolyticus. Tuy nhiên, dòng vi khuẩn này không phải lúc nào cũng gây bệnh EMS/AHPND trên tôm nuôi. Một phương pháp chuẩn đoán nhanh và chính xác mầm bệnh là rất cần thiết để kiểm soát dịch bệnh EMS/AHPND trên tôm nuôi.
Nhằm phân biệt các trình tự gen khác nhau của các dòng vi khuẩn V. parahaemolyticus, chúng tôi đã bước đầu xác định được trình tự gen của 6 dòng vi khuẩn này được phân lập từ các vùng nuôi tôm khác nhau của Thái Lan: 3 dòng phân lập từ tôm thẻ chân trắng (L. vannamei) bệnh EMS/AHPND (TUMSAT_DE1_S1, TUMSAT_DE2_S2, và TUMSAT_D06_S3) và 3 dòng vi khuẩn không gây bệnh phân lập từ các trang trại nuôi tôm khác nhau (TUMSAT_H01_S4, TUMSAT_H03_S5, và TUMSAT_H10_S6). Tất cả các dòng vi khuẩn gây bệnh EMS/AHPND đều được đánh giá khả năng gây bệnh bằng cách gây cảm nhiễm trên tôm. Tất cả các dòng vi khuẩn kiểm tra đều cho thấy tôm bệnh có những biểu hiện giống với tôm nhiễm tự nhiên trong ao nuôi.
Kết quả phân tích cho thấy, các chủng vi khuẩn gây bệnh EMS/AHPND đều có các đoạn trình tự bảo tồn (conserved sequences) trước đây chưa từng được báo cáo trên các chủng vi khuẩn V. parahaemolyticus phân lập được. Những đoạn trình tự bảo tồn này có thể liên quan đến độc lực hay khả năng gây bệnh EMS/AHPND của chúng trên tôm.
Số hiệu định danh của các trình tự này trên các cơ sở dữ liệu của DDBJ/EMBL/GenBank là BAVF01000001 –BAVF01000127, BAVG01000001 – BAVG01000096, BAVH01000001 – BAVH01000069, BAVI01000001 –BAVI01000070, BAVJ01000001 – BAVJ01000059, và BAVK01000001 – BAVK01000064.
Triệu Tuấn, trieutuan.blog
Source: Kondo H, Tinwongger S, Proespraiwong P, Mavichak R, Unajak S, Nozaki R, Hirono I. 2014. Draft genome sequences of six strains of Vibrio parahaemolyticus isolated from early mortality syndrome/acute hepatopancreatic necrosis disease shrimp in Thailand. Genome Announc. 2(2):e00221-14. doi:10.1128/genomeA.00221-14.